L’intérêt géologique de la grotte est fondamental.
Toutes les étapes de sa formation, qui a duré plusieurs millions d’années, sont encore visibles : creusement par la corrosion de l’eau, effondrements, remplissages et vidanges successifs en eau, sable ou argile, formation des stalactites, stalagmites, colonnes, draperies, disques, excentriques, gours, planchers stalagmitiques, cassure ou usure des ces différents types de concrétions ont laissé leur trace dans telle ou telle partie de la cavité.
Il s’agit d’une véritable mémoire de la Terre.